使用范圍不同

專用發票都是用于一般納稅人之間的生產經營增值稅應稅項目，普通發票是用在所有納稅人的一切經營活動，不過也包括一般納稅人的生產經營增值稅應稅項目的。

用友軟件的小規模納稅人只能開具普通發票，是不可以開具增值稅專用發票的，不過如果小規模納稅人銷售貨物與應稅勞務的一般納稅人，當買方要求賣方提供增值稅發票，那么可以讓稅務機關來代開增值稅專用發的。

作用不同

普通發票是一種商事憑證，而專用發票不僅是一種商事憑證，也是一種扣稅憑證。

價格特征的不同

普通發票體現的是含稅價，并且增值稅專用發票體現的價格是不含稅價等其他內容的。